Tập tin:Propofol woctanol.webm
The media handler extension for this file format is missing. Advanced media features may not work unless the file is viewed at Wikimedia Commons.
Kích thước hình xem trước: 800×450 điểm ảnh. Độ phân giải khác: 320×180 điểm ảnh | 640×360 điểm ảnh | 1.280×720 điểm ảnh.
Tập tin gốc (kích thước tập tin: 1,16 MB, kiểu MIME: video/webm)
| Tập tin này từ Wikimedia Commons. Trang miêu tả nó ở đấy được sao chép dưới đây. Commons là kho lưu trữ tập tin phương tiện có giấy phép tự do. Bạn có thể tham gia. |
Miêu tả
| Miêu tả |
English: 3D space-filling model of Propofol under physiological conditions (pH 7.4) and under ALPB wetoctanol model.
Tiếng Việt: Mô hình không gian 3D của Propofol trong điều kiện sinh lý (pH 7.4) và mô hình dung môi ALPB wetoctanol. |
| Ngày | |
| Nguồn gốc | Tác phẩm được tạo bởi người tải lên |
| Tác giả | Geoopt1234 |
Molecular Identifier
InChI: InChI=1S/C12H18O/c1-8(2)10-6-5-7-11(9(3)4)12(10)13/h5-9,13H,1-4H3
InChIKey: OLBCVFGFOZPWHH-UHFFFAOYSA-N
Computational Methodology
- Geometry Optimization: GFN2-xTB (xtb 6.7.1pre) with triple-extreme accuracy (
--acc 0.0001 --ohess extreme --input gbsa_extreme.inp) - Solvent Model: ALPB implicit solvation of wetoctanol
- Protonation State: Net charge = 0 at physiological pH 7.4
- Convergence: gnorm = 0.000031680080 (rigorous optimization criteria)
Visualization Details
Color Scheme (CPK):
- Gray: Carbon
- White: Hydrogen
- Red: Oxygen
Software & Sources
- Structure Source: PubChem CID
- Geometry Optimization: xtb 6.7.1pre (5071a88)
- Molecular Editor: Avogadro 2 (1.102.1)
- Visualization: Jmol-16.3.33
- Animation: FFmpeg (
ffmpeg -y -framerate 20 -i frame_%03d.png -c:v libvpx-vp9 -pix_fmt yuva420p -b:v 0 -crf 18 -loop 0 Propofol.webm) - InChI Generation: IUPAC InChI Web Demo
SDF and imaginary frequency check
Command : xtb Propofol.sdf --alpb woctanol --acc 0.0001 --ohess extreme --input gbsa_extreme.inp where gbsa_extreme.inp file is
$gbsa gbsagrid=extreme $end
ImaginaryFrequencyCheckFILE
eigval : -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 eigval : 14.89 27.51 66.03 120.13 162.49 178.80 eigval : 192.29 212.99 218.62 220.54 249.46 258.13 eigval : 292.59 297.39 306.10 401.81 421.65 445.54 eigval : 490.61 513.38 516.33 577.35 605.96 696.50 eigval : 703.77 805.49 814.98 842.57 900.86 917.52 eigval : 934.07 941.96 945.09 961.87 983.61 986.05 eigval : 1067.92 1080.36 1110.27 1125.23 1135.43 1136.78 eigval : 1171.26 1183.63 1193.47 1206.77 1253.18 1289.79 eigval : 1295.59 1302.67 1309.82 1335.16 1359.36 1398.75 eigval : 1402.50 1413.40 1417.54 1455.13 1467.30 1488.77 eigval : 1491.40 1491.82 1492.86 1498.59 1500.41 1502.17 eigval : 1503.64 1588.32 1597.06 2896.73 2964.99 3021.00 eigval : 3021.17 3024.84 3025.05 3025.42 3027.46 3028.94 eigval : 3029.63 3035.65 3037.94 3045.68 3049.35 3069.62 eigval : 3082.20 3091.19 3470.33
Propofolopt.sdf
energy: -38.965756765824 gnorm: 0.000031680080 xtb: 6.7.1pre (5071a88)
11152510393D
31 31 0 0 0 999 V2000
-2.2896 -2.6773 -0.3050 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.4436 -2.1755 -2.6254 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.2970 2.3822 2.1235 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2707 2.8600 -0.1584 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.8758 -1.4405 0.1198 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.6980 -1.9249 -0.4182 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.9779 -0.1023 0.4410 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.6723 -1.6158 -1.2191 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.1022 2.2360 0.6110 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.3823 -1.0862 -0.6346 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.9218 0.7779 0.2361 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.2671 0.2712 -0.3020 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.3668 1.0497 -0.5313 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.4484 -2.2719 0.6919 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-3.2484 -3.0017 -0.7037 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.6398 -3.5453 -0.2233 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-0.7718 -3.0301 -2.5989 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.0066 -1.4148 -3.2687 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.3890 -2.4943 -3.0589 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.3794 3.4332 2.3924 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.2004 1.8723 2.4470 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.4527 1.9512 2.6580 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.3402 3.9226 0.0650 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.1256 2.7383 -1.2299 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
3.2122 2.3913 0.1139 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.7111 -2.1042 0.2878 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.6182 -2.9711 -0.6712 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.9002 0.2686 0.8615 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-2.3741 -0.7808 -1.2944 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
0.2083 2.8130 0.3447 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
-1.2028 1.9616 -0.2571 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1 8 1 0 0 0 0
2 8 1 0 0 0 0
3 9 1 0 0 0 0
4 9 1 0 0 0 0
5 6 2 0 0 0 0
5 7 1 0 0 0 0
6 10 1 0 0 0 0
7 11 2 0 0 0 0
8 10 1 0 0 0 0
9 11 1 0 0 0 0
10 12 2 0 0 0 0
11 12 1 0 0 0 0
12 13 1 0 0 0 0
1 14 1 0 0 0 0
1 15 1 0 0 0 0
1 16 1 0 0 0 0
2 17 1 0 0 0 0
2 18 1 0 0 0 0
2 19 1 0 0 0 0
3 20 1 0 0 0 0
3 21 1 0 0 0 0
3 22 1 0 0 0 0
4 23 1 0 0 0 0
4 24 1 0 0 0 0
4 25 1 0 0 0 0
5 26 1 0 0 0 0
6 27 1 0 0 0 0
7 28 1 0 0 0 0
8 29 1 0 0 0 0
9 30 1 0 0 0 0
13 31 1 0 0 0 0
M END
$$$$
Giấy phép
Tôi, người giữ bản quyền tác phẩm này, từ đây phát hành nó theo giấy phép sau:
 
|
Tập tin này được phân phối theo Creative Commons Hiến tặng vào Phạm vi Công cộng Toàn thế giới CC0. |
| Người nào gán tài liệu này với tác phẩm nghĩa là đã hiến tác phẩm cho phạm vi công cộng bằng cách từ bỏ mọi quyền lợi của người đó đối với tác phẩm theo quy định của luật bản quyền, có hiệu lực trên toàn thế giới và các quyền lợi pháp lý phụ mà người đó có được trong tác phẩm, đến mức độ mà luật pháp cho phép. Bạn được tự do sao chép, phân phối, và biểu diễn tác phẩm này, tất cả đều không bắt buộc ghi công.
|
Lịch sử tập tin
Nhấn vào ngày/giờ để xem nội dung tập tin tại thời điểm đó.
| Ngày/giờ | Hình xem trước | Kích cỡ | Thành viên | Miêu tả | |
|---|---|---|---|---|---|
| hiện tại | 21:09, ngày 15 tháng 11 năm 2025 |  | (1,16 MB) | wikimediacommons>Geoopt1234 | Uploaded own work with UploadWizard |
Trang sử dụng tập tin
Chưa có trang nào ở Wikipedia tiếng Việt liên kết đến tập tin này.